Được lãnh đạo bởi Cơ trưởng Kirk điềm tĩnh, phi hành đoàn của phi thuyền Enterprise tiến sâu vào không gian xa xôi để khám phá những thế giới và nền văn minh mới.

Cơ trưởng Kirk và phi hành đoàn Enterprise dũng cảm có xung đột nguy hiểm với Klingon, Romulan, nhân vật hình người huyền bí và các chủng tộc người ngoài hành tinh khác.

Phi hành đoàn của 2 tàu vũ trụ Enterprise và Excelsior bằng mọi cách phải ngăn chặn cho được một âm mưu của những kẻ hiếu chiến nhằm phá hoại đàm phán hòa bình giữa phe Liên Bang và đế quốc Klingon……

Đó là thế kỷ 23. Liên bang Starship U.S.S. Enterprise đang thực hiện các cuộc diễn tập huấn luyện thường lệ và Đô đốc James T. Kirk dường như cam chịu thực tế rằng chuyến thị sát này có thể là sứ mệnh không gian cuối cùng trong sự nghiệp của ông. Nhưng Khan đã trở lại. Được hỗ trợ bởi nhóm siêu nhân di truyền bị lưu đày của mình, Khan – kẻ phản bội xuất sắc của Trái đất thế kỷ 20 – đã đột kích vào Trạm vũ trụ Regula One, đánh cắp một thiết bị tuyệt mật có tên Project Genesis, giành quyền kiểm soát một Con tàu vũ trụ khác của Liên bang và bắt đầu truy đuổi Enterprise, quyết tâm không để bất cứ điều gì cản trở nhiệm vụ của mình: giết Đô đốc Kirk… ngay cả khi điều đó có nghĩa là Armageddon toàn cầu.

Đó là thế kỷ 23, và một sức mạnh bí ẩn ngoài hành tinh đang đe dọa Trái đất bằng cách làm bốc hơi các đại dương và phá hủy bầu khí quyển. Trong một nỗ lực điên cuồng để cứu nhân loại, Kirk và phi hành đoàn của anh phải du hành thời gian trở lại San Francisco năm 1986, nơi họ tìm thấy một thế giới của nhạc punk, bánh pizza và những chiếc xe buýt thay đổi chính xác xa lạ như bất cứ thứ gì họ từng gặp ở những nơi xa xôi Thiên hà. Một cuộc phiêu lưu Star Trek ly kỳ, đầy hành động!

Tại thành phố San Francisco đẹp đẽ, người dân đi lại tấp nập, trẻ con vui chơi trong công viên và cuộc sống của con người ở đây tưởng chừng như không bao giờ bị đe dọa. Nhưng một ngày nọ, Elizabeth Driscoll (Brooke Adams) là nhân viên của sở y tế đã phát hiện ra một loại hoa lạ và mang về nhà. Sau một đêm, người bạn trai của cô trở nên kỳ lạ, như thể mọi cảm xúc của anh ta đã bị lấy đi. Dần dần, từ người một cũng trở nên kỳ lạ như bạn trai của Elizabeth, khiến cô phải nhờ tới người đồng nghiệp Matthew Bennell (Donald Sutherland) của mình. Chuyện gì đang xảy ra với người dân thành phố San Francisco? Liệu Elizabeth và Matthew có thể cứu được tất cả mọi người không?

Tiếp tục những chuyến phiêu lưu ngoài vũ trụ, Spock đến thăm hành tinh quê nhà, Scotty đối mặt với tội giết người và nhà hàng hải người Nga Chekov gia nhập Enterprise.

Trong quá trình đàm phán hòa bình với người Klingon, thuyền trưởng Kirk và ngài Spock bị buộc tội giết người khi tàu của người Klingon bị tấn công.

Trong hành trình tìm kiếm Chúa đầy ám ảnh, một người Vulcan nổi loạn cướp tàu Enterprise rồi đưa thuyền trưởng Kirk cùng phi hành đoàn đến trung tâm của thiên hà.

Khi một thực thể không gian hủy diệt được phát hiện đang tiến đến Trái đất, Đô đốc Kirk tiếp tục chỉ huy Starship Enterprise để ngăn chặn, kiểm tra và hy vọng ngăn chặn được nó.